疾管署統計，國內新冠疫情上升，第25週(6/21-6/27)新冠門急診就診計1,452人次，較前一週上升43.8%；上週(6/23-6/29)新增8例新冠併發重症本土病例，無新增本土死亡病例。114年10月起累計105例新冠併發重症本土病例，其中16例死亡，重症病例以65歲以上長者(占71.4%)及具慢性病史者(占81.9%)為多，94.3%未接種本季新冠疫苗。全球近期新冠病毒陽性率呈略升，其中，西太平洋及東地中海區署陽性率明顯增加；鄰近國家/地區中國、香港、日本疫情上升，韓國疫情於低點波動。全球目前流行變異株占比以NB.1.8.1為主，其次為BA.3.2及JN.1，鄰近國家如中國、香港則以NB.1.8.1占比為高。另截至今(2026)年6月28日，本季新冠疫苗接種累計約172.8萬人次，65歲以上長者接種率分別為第1劑20.97%、第2劑0.48%。
疾管署提醒，目前公費新冠疫苗擴大提供全國滿6個月(180天)以上民眾接種措施至今年7月31日止，且疫苗庫存尚約有46.1萬劑(包含Moderna疫苗單劑型45.5萬劑及Novavax疫苗0.6萬劑)，民眾可把握機會儘快接種，而65歲以上長者等高風險對象尚未接種或已接種第1劑且間隔達6個月，也呼籲儘快接種，以提升免疫保護力。另目前適用幼兒接種之Moderna疫苗多劑型疫苗已用罄，經衛生福利部傳染病防治諮詢會預防接種組(ACIP)於今年6月24日會議討論同意，對於具接種需求之滿6個月至11歲幼童，可以Moderna疫苗單劑型排掉半劑量後剩餘劑量提供幼兒接種。
疾管署呼籲，全球新冠疫情仍持續，民眾不可輕忽，務必做好勤洗手、戴口罩、打疫苗等自我防護。具重症風險因子對象(如65歲以上、孕婦、具慢性疾病或免疫功能低下者)，為併發重症之高風險族群，如出現疑似症狀應儘速就醫，由醫師評估後開立抗病毒藥物進行治療，降低感染後導致嚴重併發重症或死亡風險。民眾亦可至有販售家用快篩試劑的超商或藥局購買試劑先行自我檢測，以利後續醫師診治；目前抗病毒藥物儲備量充足，口服抗病毒藥物(倍拉維、舒冠效)尚有11.3萬人份，注射用的瑞德西韋亦有庫存15.6萬劑，各縣市衛生局並將視各配置點使用情形即時進行調度管理，請民眾安心。