依據疾管署監測資料顯示，第46週(11/9-11/15)類流感門急診就診計93,247人次，較前一週下降9.1%；另近7日新增42例流感併發重症病例(10例H1N1、30例H3N2、2例A未分型)及10例死亡(4例H1N1、6例H3N2)。本(2025-2026)流感季累計300例重症病例(100例H1N1、193例H3N2、3例A未分型、4例B型)及35例死亡(12例H1N1、22例H3N2、1例B型)，其中重症病例以65歲以上長者(占64%)及具慢性病史者(占82%)為多，95%未接種本季流感疫苗。依實驗室監測資料顯示，目前社區中流行之呼吸道病原體以流感病毒為主，其中以A型H3N2為多，其次為A型H1N1及B型。全球流感病毒陽性率於近期處低點穩定，流行型別以A型為多，鄰近國家如日本、韓國疫情呈上升趨勢，中國近期活動度及陽性率皆上升，東亞/東南亞主要流行型別為A(H3N2)；北歐、中美洲及加勒比地區近期活動度及陽性率亦皆上升，主要流行型別為A(H1N1)及A(H3N2)。
疾管署說明，國內新冠疫情目前處低點波動，第46週新冠門急診就診計1,161人次，較前一週下降9.9%，主流變異株為NB.1.8.1。全球近期新冠病毒陽性率呈波動下降趨勢，惟非洲及東地中海區署陽性率增加。全球流行變異株以XFG占比最高，其次為NB.1.8.1，鄰近國家/地區如中國、香港、日本、韓國仍以NB.1.8.1占比為高。
疾管署表示，近期氣溫下降，呼吸道病毒更為活躍，依監測資料顯示，新冠病毒持續活躍於社區，仍有重症及死亡病例發生，自今年10月1日新冠疫苗開打以來，新增病例未接種新冠疫苗者占96.3%，疾病威脅不可輕忽，提醒尚未接種的公費對象，尤其是65歲以上長者及具慢性疾病等高風險族群，儘快接種新冠疫苗，降低感染後併發重症及死亡風險。
疾管署提醒，近期氣溫變化明顯，請民眾務必防範呼吸道傳染病，並持續留意流感及新冠併發重症發生風險，若出現呼吸困難、呼吸急促、發紺、血痰、胸痛、意識改變、低血壓等危險徵兆，應儘速就醫以及時獲得治療，並呼籲長者、幼兒及慢性病患等高風險族群應儘速完成流感及新冠疫苗接種，獲得保護力，降低感染後發生重症和死亡之風險。今年約有4,400餘家接種合約院所，另全聯、大全聯及家樂福亦於指定門市及時段設置疫苗接種站，民眾可先透過各地方政府衛生局網頁、流感新冠疫苗及流感藥劑地圖(https://vaxmap.cdc.gov.tw)、疾管署全球資訊網首頁「114年左流右新健康安心疫苗接種專區」、疾管家或1922防疫諮詢專線，查詢鄰近合約院所，再電洽院所詢問預約，以確保可施打到疫苗且節省排隊等候時間。
