疾病管制署(下稱疾管署) 2026年9月22日表示，國內腸病毒疫情持續，由於腸病毒易於人口密集且互動頻繁場所傳播，例如校園、安親班、托嬰中心及室內兒童遊戲場等，提醒家長及教托育人員提高警覺，持續教導學幼童養成良好的個人衛生習慣，加強以肥皂正確勤洗手，並落實環境清潔消毒，流行期間避免出入擁擠的公共場所，落實生病在家休息等措施，以降低傳播風險。
依據疾管署監測資料顯示，腸病毒就診人次第37週(9月13日至9月19日)門急診就診計10,359人次，與前一週(10,400人次)相當，須觀察連續假期後疫情變化；近四週實驗室監測顯示社區腸病毒以克沙奇A6型為多，其次為腸病毒D68型及克沙奇A16型。今(2026)年累計7例腸病毒感染併發重症確定病例(含1例死亡)，分別為感染腸病毒D68型5例，克沙奇A4型及克沙奇A16型各1例；呼籲民眾留意嬰幼童健康狀況與腸病毒重症前兆病徵。
疾管署提醒，腸病毒傳染力強，無論成人或兒童皆有感染風險，提醒大人外出返家後於摟抱或餵食嬰幼兒前，務必以肥皂或洗手乳正確洗手，並時常清潔及消毒幼兒常接觸之物品及玩具，保持活動空間環境通風，以降低嬰幼兒感染腸病毒的機會。另須注意酒精對腸病毒之毒殺效果有限，一般環境消毒可使用濃度500 ppm的消毒水（10公升清水+100毫升市售家庭用漂白水）；如遭病童口鼻分泌物、嘔吐物或排泄物污染之物品或表面，建議使用1,000ppm濃度的含氯漂白水消毒(1公升清水加20毫升漂白水，攪拌均勻後使用)；消毒水擦拭完畢後，需靜待10分鐘再用清水擦拭一次。
疾管署呼籲，5歲以下嬰幼兒為腸病毒重症高危險群，且重症病程發展快速，如經醫師診斷感染腸病毒，請留意學幼童健康狀況，如有嗜睡、意識不清、活力不佳、手腳無力或麻痺、肌抽躍(無故驚嚇或突然間全身肌肉收縮)、持續嘔吐與呼吸急促或心跳加快等腸病毒重症前兆病徵，請儘速送到大醫院接受治療。相關資訊可至疾管署全球資訊網(https://www.cdc.gov.tw)，或撥打免付費防疫專線1922(或0800-001922)洽詢。